Strukturalne wglądy w rozpoznawanie metylowanego DNA przez domenę wiążącą metyl-CpG MBD6 z Arabidopsis thaliana
Ewa
- 0
Metylacja cytozyny jest modyfikacją epigenetyczną niezbędną do tworzenia dojrzałej heterochromatyny, wyciszania genów i stabilności genomu. W roślinach metylacja zachodzi nie tylko w obrębie zasad cytozyny w CpG, ale także w kontekstach CpHpG i CpHpH, gdzie H oznacza A, T lub C. Białka z domeną wiążącą metyl-CpG (MBD), które rozpoznają symetryczne dinukleotydy represory genów w komórkach ssaków są również obecne w komórkach roślinnych, chociaż ich właściwości strukturalne i funkcjonalne wciąż pozostają słabo poznane.
Aby wypełnić tę lukę, w tym badaniu określiliśmy strukturę roztworu domeny MBD białka MBD6 z Arabidopsis thaliana i zbadaliśmy jego właściwości wiązania z metylowanym DNA za pomocą testów wiązania i dogłębnej analizy spektroskopowej NMR. Domena AtMBD6 MBD fałduje się w kanoniczną strukturę MBD zgodnie ze swoistością wiązania z metylo-CpG i posiada interfejs wiązania DNA podobny do ssaczych domen MBD.
Co jednak intrygujące, stwierdzono, że powinowactwo wiązania domeny MBD AtMBD6 z DNA zawierającym metylo-CpG jest znacznie niższe niż w przypadku znanych domen MBD ssaków.
Główna różnica wynika z braku dodatnio naładowanych reszt w AtMBD6, które przypuszczalnie oddziałują ze szkieletem DNA, jak widać w ssaczych kompleksach DNA MBD/metylo-CpG. Podsumowując, stworzyliśmy strukturalne podstawy rozpoznawania metylo-CpG przez AtMBD6, aby lepiej zrozumieć, w jaki sposób białka MBD działają jako mediatory sygnałów epigenetycznych w komórkach roślinnych.
- Czynniki transkrypcyjne (TF) to białka zaangażowane w regulację ekspresji genów. W epigenetyce ogólnie przyjmuje się, że metylowane nukleotydy mogą zapobiegać wiązaniu TF z fragmentami DNA. Jednak ostatnie badania potwierdziły, że niektóre TF mają zdolność do interakcji z metylowanymi fragmentami DNA w celu dalszej regulacji ekspresji genów.
- Chociaż eksperymenty biochemiczne mogą rozpoznać TF wiążące się z metylowanymi sekwencjami DNA, te mokre metody eksperymentalne są czasochłonne i kosztowne. Metody uczenia maszynowego stanowią dobry wybór do szybkiej identyfikacji tych TF bez użycia materiałów eksperymentalnych .
- W związku z tym badanie to ma na celu zaprojektowanie solidnego predyktora do wykrywania TF związanych z metylowanym DNA. Najpierw zaproponowaliśmy użycie funkcji wektora słowa tripeptydowego do formułowania próbek białka. Następnie, w oparciu o sieć neuronową rekurencyjną z długotrwałą pamięcią krótkotrwałą, zaprojektowano dwuetapowy model obliczeniowy. Predyktor pierwszego kroku został wykorzystany do odróżnienia czynników transkrypcyjnych od czynników nietranskrypcyjnych.
- Gdy białka zostały określone jako TF, zastosowano predyktor drugiego etapu, aby ocenić, czy TF mogą wiązać się z metylowanym DNA . W niezależnym teście zbioru danych dokładność pierwszego i drugiego kroku wynosi odpowiednio 86,63% i 73,59%. Ponadto analiza statystyczna dystrybucji tripeptydów w próbkach treningowych wykazała, że pozycja i liczba niektórych tripeptydów w sekwencji może wpływać na wiązanie TF z metylowanym DNA.
- Ostatecznie w oparciu o nasz model powstał darmowy serwer WWW oparty na proponowanym modelu, który jest dostępny pod adresem https://bioinfor.nefu.edu.cn/TFPM/
Metylowane DNA jest nie tylko biomarkerem diagnostycznym, ale także prognostycznym dla wczesnego stadium raka.
Jednak sekwencjonowanie wodorosiarczynem sodu jako „złoty standard” metody wykrywania markerów metylacji ma pewne wady, takie jak czasochłonność i pracochłonność procedur. Dlatego do analizy sekwencji DNA z resztami metylowanymi lub bez nich wymagane są proste i niezawodne metody.
Proponujemy tutaj prostą i bezpośrednią metodę wykrywania metylacji DNA poprzez jego przejście konformacyjne do G-kwadrupleksu przy użyciu tranzystora polowego bramkowanego roztworem (SG-FET) bez użycia materiałów znakowanych. Gen BCL-2 , który bierze udział w rozwoju różnych guzów ludzkich, zawiera segmenty G-bogate i ulega zmianie konformacyjnej do G-kwadrupleksu w zależności od stężenia K + .
Skumulowane nici G-kwadrupleksów poruszają się blisko powierzchni czujnika SG-FET, co skutkuje dużymi sygnałami elektrycznymi opartymi na wewnętrznych ładunkach molekularnych. Ponadto gęstą hydrofilową szczoteczkę polimerową zaszczepia się za pomocą inicjowanej powierzchniowo polimeryzacji rodnikowej z przeniesieniem atomu na powierzchnię czujnika SG-FET w celu zmniejszenia szumu elektrycznego w oparciu o niespecyficzną adsorpcję substancji zakłócających.
W szczególności kontrola grubości szczotki polimerowej indukuje sygnały elektryczne w oparciu o ładunki molekularne DNA w warstwie dyfuzyjnej, zgodnie z limitem długości Debye’a. Platforma oparta na czujniku SG-FET z dobrze zdefiniowaną szczoteczką polimerową jest odpowiednia do monitorowania in situ metylowanego DNA i stanowi urządzenie przyłóżkowe o wysokim stosunku sygnału do szumu i bez konieczności stosowania dodatkowych procesów takie jak konwersja wodorosiarczynu i reakcja łańcuchowa polimerazy.
Kilka leków przeciwnowotworowych opiera swoją cytotoksyczność na ich zdolności do interkalowania między parami zasad DNA.
Niemniej jednak ustalono, że mechanizm interkalacji leków w DNA rozpoczyna się od wcześniejszego sposobu interakcji leku z DNA wiązania rowka. Czasami, dla pewnego rodzaju płaskich małych cząsteczek, wiązanie przez rowki nie daje żadnego efektu cytotoksycznego i pożądane jest szybkie przejście takich płaskich małych cząsteczek do trybu interkalacji cytotoksycznej. Tak jest w przypadku metylowanych pochodnych fenantroliny (fen), gdzie zmiany w podstawieniu w pozycji i liczbie grup metylowych decydują o ich zdolności jako związków cytotoksycznych, a zatem jest to sposób na modulację efektów cytotoksycznych.
W tej pracy zbadaliśmy tę modulację za pomocą interakcji kompleksu [Pt(en)(phen)] 2+ i kilku pochodnych przez metylację fenu w różnej liczbie i pozycji oraz heksameru DNA d(GTCGAC) 2 przez rowek wiązanie przy użyciu metod PM6-DH2 i DFT-D. Analizę geometrii, struktury elektronowej i energetyki badanych układów porównano z pracami eksperymentalnymi, aby uzyskać wgląd w związek struktura-oddziaływanie dla badanych układów z cytotoksycznością.Trendy są wyjaśnione za pomocą wskaźnika interakcji niekowalencyjnych (NCI), analizy rozkładu energii (EDA) i wkładów solwatacyjnych. Nasze wyniki są zgodne z doświadczeniami, w których metylacja pozycji 4 fenu wydaje się faworyzować interakcję poprzez wiązanie rowka, co utrudnia przejście do interkalacyjnego trybu cytotoksycznego.
MethylFlash Methylated DNA Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-1035 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Methylated DNA 5-mC Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-1034 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Hydroxymethylated DNA Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-1037 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash 5-Formylcytosine (5-fC) DNA Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-1041 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Hydroxymethylated DNA 5-hmC Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-1036 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Urine 5-Methylcytosine (5-mC) Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-1039 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Urine 5-Methylcytosine (5-mC) Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-1040 | EpiGentek |
|
|
SuperSense Methylated DNA Quantification Kit |
|||
P-1021 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Urine N6-methyladenosine (m6A) Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-9015 | EpiGentek |
|
|
Methylamp Global DNA Methylation Quantification Ultra Kit |
|||
P-1014B | EpiGentek |
|
|
EpiQuik m6A RNA Methylation Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-9005 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik m6A RNA Methylation Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-9008 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Global DNA Methylation (5-mC) ELISA Easy Kit (Colorimetric) |
|||
P-1030 | EpiGentek |
|
|
Hi-PCR® Carbapenemase Gene Quantificatio |
|||
MBPCR227-50R | EWC Diagnostics | 1 unit | 686.64 EUR |
MethylFlash 5-mC RNA Methylation ELISA Easy Kit (Fluorometric) |
|||
P-9009 | EpiGentek |
|
|
DNA Quantification Kit |
|||
KT-045 | Kamiya Biomedical Company | 1 kit | 794 EUR |
DNA Damage Quantification Kit |
|||
55R-1345 | Fitzgerald | 25 assays | 660 EUR |
DNA Damage Quantification Kit |
|||
GWB-AXR165 | GenWay Biotech | 25 assays | Ask for price |
Low Abundance DNA Quantification Kit |
|||
57200 | Norgen Biotek Corp | 48 Samples | 167.4 EUR |
FitAmp General DNA Quantification Kit |
|||
P-1020 | EpiGentek |
|
|
Broad Range DNA Quantification Kit, 100 assays |
|||
NS1020-BR-100 | Benchmark Scientific | 1 each | 133.93 EUR |
DNA Quantification Assay Kit (Fluorometric) |
|||
K539-200 | Biovision | each | 314.4 EUR |
DNA Quantification Assay Kit (Fluorometric) |
|||
K539-2000 | Biovision | each | 470.4 EUR |
FitAmp Circulating DNA Quantification Kit |
|||
P-1012 | EpiGentek |
|
|
MethylFlash Global DNA Hydroxymethylation (5-hmC) ELISA Easy Kit (Colorimetric) |
|||
P-1032 | EpiGentek |
|
|
DNA Damage Quantification Colorimetric Kit |
|||
K2100-25 | ApexBio | 25 assays | 729.6 EUR |
DNA Damage Quantification Colorimetric Kit |
|||
K253-25 | Biovision | each | 732 EUR |
Library Quantification DNA Standards (S1-S6) |
|||
20-abx098897 | Abbexa |
|
|
High Sensitivity DNA Quantification Kit, 100 assays |
|||
NS1020-HS-100 | Benchmark Scientific | 1 each | 133.93 EUR |
RoboGene HBV DNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 32 reactions |
|||
RS847-0207710032 | Westburg | each | 503.58 EUR |
RoboGene HBV DNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 96 reactions |
|||
RS847-0207710096 | Westburg | each | 1384.3 EUR |
RoboGene HBV DNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 192 reactions |
|||
RS847-0207710192 | Westburg | each | 2528.8 EUR |
Human genomic DNA quantification kit with Double Dye probe |
|||
Z-gDNA-hu-q-DD | Novacyt Group | 150 tests | 301 EUR |
Mutation Quantification Control Plasma with 50 ng spike in DNA |
|||
Z2010003 | Biochain | 5 ml | 172.98 EUR |
Mutation Quantification Control Plasma with 250 ng spike in DNA |
|||
Z2010004 | Biochain | 25 ml | 578 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina DNA Standard 1 - 6 |
|||
NQ105-00-2rxns | Vazyme | 2 rxns | 1.09 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina DNA Standard 1 - 6 |
|||
NQ105-696ul | Vazyme | 6 × 96 μl | 222.11 EUR |
EpiQuik 8-OHdG DNA Damage Quantification Direct Kit (Colorimetric) |
|||
P-6003 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik 8-OHdG DNA Damage Quantification Direct Kit (Fluorometric) |
|||
P-6004 | EpiGentek |
|
|
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For DNA Damage/Repair - XRCC4 |
|||
P-5003 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
AAV Quantification Kit |
|||
63800 | Norgen Biotek Corp | 24 Reactions | 195 EUR |
HDL/LDL Quantification Kit |
|||
55R-1456 | Fitzgerald | 100 assays | 727 EUR |
GSSG/GSH Quantification Kit |
|||
KT-768 | Kamiya Biomedical Company | 200 tests | 854 EUR |
Cell Meterâ„¢ Colorimetric WST-8 Cell Quantification Kit |
|||
22770-1000Tests | AAT Bioquest | 1000 Tests | 222 EUR |
Cell Meterâ„¢ Colorimetric WST-8 Cell Quantification Kit |
|||
22771-5000Tests | AAT Bioquest | 5000 Tests | 558 EUR |
Biotin Quantification Kit |
|||
abx351107-96tests | Abbexa | 96 tests | 493.75 EUR |
mCherry Quantification Kit |
|||
K971-100 | Biovision | each | 477.6 EUR |
HDL and LDL/VLDL Quantification Kit |
|||
GWB-AXR284 | GenWay Biotech | 100 assays | Ask for price |
BCA Protein Quantification Kit |
|||
20201ES56 | Yeasen Biotechnology | 60T(12ml) | 20 EUR |
BCA Protein Quantification Kit |
|||
E112-01 | Vazyme | 250 rxn | 45.11 EUR |
BCA Protein Quantification Kit |
|||
E112-01-250rxns | Vazyme | 250 rxns | 46.71 EUR |
BCA Protein Quantification Kit |
|||
E112-02 | Vazyme | 500 rxn | 72.5 EUR |
BCA Protein Quantification Kit |
|||
E112-02-500rxns | Vazyme | 500 rxns | 75.07 EUR |
Hi-PCR® E. coli O157:H7 Quantification P |
|||
MBPCR198-50R | EWC Diagnostics | 1 unit | 686.64 EUR |
Free Fatty Acid Quantification Kit |
|||
55R-1455 | Fitzgerald | 100 assays | 687 EUR |
BCA Protein Quantification Kit BCA |
|||
20201ES76 | Yeasen Biotechnology | 500T(100ml) | 130 EUR |
BCA Protein Quantification Kit BCA |
|||
20201ES86 | Yeasen Biotechnology | 2500T(500ml) | 520 EUR |
BCA Protein Quantification Kit BCA |
|||
20201ES90 | Yeasen Biotechnology | 5000T(1000) | 832 EUR |
Free Fatty Acid Quantification Kit |
|||
GWB-AXR283 | GenWay Biotech | 100 assays | Ask for price |
Mouse IgG Quantification ELISA Kit |
|||
K4161-100 | Biovision | each | 373.2 EUR |
1X dsDNA HS Quantification Kit for Qubit |
|||
TRI-B83M1 | TRI Biotech | 500T | 1282.68 EUR |
1X dsDNA HS Quantification Kit for Qubit |
|||
TRI-B83S1 | TRI Biotech | 100T | 282.24 EUR |
Rat Methylated DNA Control |
|||
D6434149 | Biochain | 5 ug | Ask for price |
Pico488 dsDNA quantification kit, 200 |
|||
1102-200 | Lumiprobe | 200 assays | 348 EUR |
Pico488 dsDNA quantification kit, 200 |
|||
B1102 | Lumiprobe | 200 assays | 382.8 EUR |
Human Methylated DNA Control |
|||
D6255815 | Biochain | 5 ug | 107.8 EUR |
Mouse Methylated DNA Control |
|||
D6334149 | Biochain | 5 ug | Ask for price |
Methylamp Universal Methylated DNA Kit |
|||
P-1011 | EpiGentek |
|
|
Low Abundance RNA Quantification Kit |
|||
58900 | Norgen Biotek Corp | 1 Unit | 201 EUR |
NGS Library Quantification Hi-ROX Kit |
|||
abx461032-1096tests | Abbexa | 10 × 96 tests | Ask for price |
NGS Library Quantification Hi-ROX Kit |
|||
abx461032-596tests | Abbexa | 5 × 96 tests | Ask for price |
NGS Library Quantification Hi-ROX Kit |
|||
abx461032-96tests | Abbexa | 96 tests | 1750 EUR |
NGS Library Quantification Lo-ROX Kit |
|||
abx461033-1096tests | Abbexa | 10 × 96 tests | Ask for price |
NGS Library Quantification Lo-ROX Kit |
|||
abx461033-596tests | Abbexa | 5 × 96 tests | Ask for price |
NGS Library Quantification Lo-ROX Kit |
|||
abx461033-96tests | Abbexa | 96 tests | 1400 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3001 | Abbkine | 500 T | Ask for price |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3001-2500T | Abbkine | 2500T | 169 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3001-500T | Abbkine | 500 T | 69 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3001-each | Abbkine | each | Ask for price |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9711521-2000Tests | MyBiosource | 2000Tests | 220 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9711521-5000Tests | MyBiosource | 5000Tests | 280 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9711521-500Tests | MyBiosource | 500Tests | 175 EUR |
Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9711521-5x5000Tests | MyBiosource | 5x5000Tests | 1230 EUR |
EpiQuik Nitrosative (8-Nitroguanine) DNA/RNA Damage Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-6009 | EpiGentek |
|
|
Triglyceride Quantification Kit |
|||
55R-1464 | Fitzgerald | 100 assays | 700 EUR |
Triglyceride Quantification Kit |
|||
GWB-AXR292 | GenWay Biotech | 100 assays | Ask for price |
Lentivirus qPCR Quantification Kit |
|||
K1471-100 | Biovision | 100 Rxns | 357.6 EUR |
Retrovirus qPCR Quantification Kit |
|||
K1472-100 | Biovision | 100 Rxns | 381.6 EUR |
RoboGene HCV RNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 32 Rxns |
|||
RS847-0207610032 | Westburg | each | 839.3 EUR |
RoboGene HCV RNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 96 Rxns |
|||
RS847-0207610096 | Westburg | each | 2332.6 EUR |
RoboGene HCV RNA Quantification Kit 3.0 (CE) - 192 Rxns |
|||
RS847-0207610192 | Westburg | each | 4033 EUR |
EZ‐PRRSV MPX 4.0 Quantification Standards |
|||
TC-9062-001 | Tetracore | each | 60 EUR |
Acetylcholine Quantification Kit |
|||
55R-1457 | Fitzgerald | 100 assays | 633 EUR |
Bradford Protein Quantification Kit |
|||
E111-01 | Vazyme | 500 rxn | 158.4 EUR |
Bradford Protein Quantification Kit |
|||
E111-02 | Vazyme | 1000 rxn | 188.4 EUR |
Library Quantification Kit for Illumina |
|||
20-abx098895 | Abbexa |
|
|
Library Quantification qPCR SuperMix |
|||
abx098896-100l | Abbexa | 100 µl | 700 EUR |
Library Quantification qPCR SuperMix |
|||
abx098896-200l | Abbexa | 200 µl | 962.5 EUR |
Library Quantification qPCR SuperMix |
|||
20-abx098896 | Abbexa |
|
|
Total Glutathione Quantification Kit |
|||
KT-767 | Kamiya Biomedical Company | 100 tests | 532 EUR |
Hi-PCR® Salmonella Quantification Probe |
|||
MBPCR196-50R | EWC Diagnostics | 1 unit | 686.64 EUR |
Lipid Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
MBS169253-100Assays | MyBiosource | 100Assays | 640 EUR |
Lipid Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
MBS169253-5x100Assays | MyBiosource | 5x100Assays | 2930 EUR |
Lipid Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
STA-617 | Cell Biolabs | 100 assays | 384 EUR |
QuantiSir General Gene Knockdown Quantification Kit |
|||
P-5001 | EpiGentek |
|
|
NGS Library Quantification Kit (for Small RNA-Seq) |
|||
61600 | Norgen Biotek Corp | 1 Unit | 69 EUR |
Amplite® Total Sulfide Quantification Kit |
|||
21300-100Tests | AAT Bioquest | 100 Tests | 318 EUR |
HiPer® Relative Quantification Teaching |
|||
HTBM039-10PR | EWC Diagnostics | 1 unit | 80.9 EUR |
HiPer® Absolute Quantification Teaching |
|||
HTBM040-10PR | EWC Diagnostics | 1 unit | 47.8 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
KTD3002-2000T | Abbkine | 2000 T | 89 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
KTD3002-5000T | Abbkine | 5000 T | 149 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
KTD3002-500T | Abbkine | 500 T | 39 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
MBS9711522-2000Tests | MyBiosource | 2000Tests | 195 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
MBS9711522-5000Tests | MyBiosource | 5000Tests | 230 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
MBS9711522-500Tests | MyBiosource | 500Tests | 160 EUR |
Protein Quantification Kit (Bradford Assay) |
|||
MBS9711522-5x5000Tests | MyBiosource | 5x5000Tests | 1010 EUR |
RoboGene HDV RNA Quantification Kit 2.0 for use with RG (CE) - 96 Rxns |
|||
RS847-0207400542 | Westburg | each | 2517.9 EUR |
RoboGene HDV RNA Quantification Kit 2.0 for use with RG (CE) - 32 Rxns |
|||
RS847-0207400544 | Westburg | each | 910.15 EUR |
Methylamp Methylated DNA Capture (MeDIP) Kit |
|||
P-1015 | EpiGentek |
|
|
QuickQuant™ Mouse IgG Quantification Kit, 30 tests |
|||
QQNT-030 | BioAssayWorks | 30 tests | 460.5 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
|||
NQ101 | Vazyme | 500 rxn | 349.2 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
|||
NQ101-00-100rxns | Vazyme | 100 rxns | 1.09 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
|||
NQ101-500rxns | Vazyme | 500 rxns | 181.21 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
|||
NQ101-NQ104 | Vazyme | 500 rxns | 175 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina |
|||
NQ102-500rxns | Vazyme | 500 rxns | 181.21 EUR |
Choline/Acetylcholine Quantification Kit |
|||
GWB-AXR285 | GenWay Biotech | 100 assays | Ask for price |
Apoptosis & Necrosis Quantification Kit (50 assays) |
|||
30017-1 | Biotium | KT | 224 EUR |
Bradford Protein Quantification Kit Bradford |
|||
20202ES76 | Yeasen Biotechnology | 500T(125ml) | 135 EUR |
Bradford Protein Quantification Kit Bradford |
|||
20202ES86 | Yeasen Biotechnology | 2500T(625ml) | 540 EUR |
Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3010-EN-500T | Abbkine | 500 T | 89 EUR |
Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3010-EN-each | Abbkine | each | Ask for price |
Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
KTD3010-EN-Null | Abbkine | Null | Ask for price |
Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9719253-500Tests | MyBiosource | 500Tests | 220 EUR |
Super-Rapid Protein Quantification Kit (BCA Assay) |
|||
MBS9719253-5x500Tests | MyBiosource | 5x500Tests | 1000 EUR |
Monkey (Rhesus) Methylated DNA Control |
|||
D6534149 | Biochain | 5 ug | Ask for price |
Adeno-Associated Virus qPCR Quantification Kit |
|||
K1473-100 | Biovision | 100 Rxns | 417.6 EUR |
QuDye Protein Quantification kit (optimized for Qubit), 100 |
|||
15102 | Lumiprobe | 100 assays | 88.8 EUR |
Methylamp Universal Methylated DNA Preparation Kit |
|||
P-1019 | EpiGentek | 40 µg | 416.7 EUR |
Genorise® Customized PCR primers for quantification |
|||
GR108024 | Genorise Scientific | 2 nmol | 65 EUR |
Pico488 dsDNA quantification reagent, 200x solution in DMSO, 100 uL |
|||
12010 | Lumiprobe | 100 uL | 70.8 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (Without ROX) |
|||
NQ102 | Vazyme | 500 rxn | 349.2 EUR |
Human Y chromosome quantification kit with Double Dye probe |
|||
Z-yDNA-hu-q-DD | Novacyt Group | 150 tests | 301 EUR |
Monkey (Cynomolgus) Methylated DNA Control |
|||
D6534149-Cy | Biochain | 5 ug | Ask for price |
Amplite® Fluorimetric Lithium Ion Quantification Kit |
|||
21351 | AAT Bioquest | 100Tests | 505 EUR |
Porteliteâ„¢ Fluorimetric Sodium Ion Quantification Kit |
|||
21327 | AAT Bioquest | 100Tests | 505 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
MBS168769-100Assays | MyBiosource | 100Assays | 730 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
MBS168769-5x100Assays | MyBiosource | 5x100Assays | 3365 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
MBS168773-100Assays | MyBiosource | 100Assays | 730 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
MBS168773-5x100Assays | MyBiosource | 5x100Assays | 3365 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (Low ROX Premixed) |
|||
NQ103 | Vazyme | 500 rxn | 349.2 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (Low ROX Premixed) |
|||
NQ103-500rxns | Vazyme | 500 rxns | 181.21 EUR |
EpiQuik Total Histone H3 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3062 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Total Histone H3 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3063 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Total Histone H4 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3072 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Total Histone H4 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3073 | EpiGentek |
|
|
RoboGene HDV RNA Quantification Kit 2.0 for use with Low Profile Block (CE) - 96 Rxns |
|||
RS847-0207400582 | Westburg | each | 2517.9 EUR |
RoboGene HDV RNA Quantification Kit 2.0 for use with Low Profile Block (CE) - 32 Rxns |
|||
RS847-0207400584 | Westburg | each | 910.15 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
STA-396 | Cell Biolabs | 100 assays | 428 EUR |
Serum Triglyceride Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
STA-397 | Cell Biolabs | 100 assays | 428 EUR |
Porteliteâ„¢ Fluorimetric Lithium Ion Quantification Kit |
|||
21353 | AAT Bioquest | 100Tests | 505 EUR |
ExoQualiTM Total Exosome Capture & Quantification Kit (Serum) |
|||
CEIK-107L-96wells | Creative Bioarray | 96 wells | Ask for price |
ExoQualiTM Total Exosome Capture & Quantification Kit (Urine) |
|||
CEIK-110L-96wells | Creative Bioarray | 96 wells | Ask for price |
Sphingomyelin Quantification Colorimetric Assay Kit |
|||
K600-100 | Biovision | each | 574.8 EUR |
Human Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ022 | ELK Biotech | 100rxns | 375 EUR |
Human Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ022-100rxns | ELK Biotech | 100rxns | 125 EUR |
Human Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ022-500rxns | ELK Biotech | 500rxns | 375 EUR |
Mouse Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ028 | ELK Biotech | 100rxns | 375 EUR |
Mouse Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ028-100rxns | ELK Biotech | 100rxns | 125 EUR |
Mouse Telomere Length Quantification qPCR Assay Kit(Relative) |
|||
EQ028-500rxns | ELK Biotech | 500rxns | 375 EUR |
Sunlong Medical™ Human OSMR ELISA Kit For Protein Quantification |
|||
EL0292Hu-48T | Sunlong | 48T | 398 EUR |
Sunlong Medical™ Human OSMR ELISA Kit For Protein Quantification |
|||
EL0292Hu-96T | Sunlong | 96T | 655 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for Illumina (High ROX Premixed) |
|||
NQ104 | Vazyme | 500 rxn | 349.2 EUR |
VAHTS Library Quantification Kit for IIIumina (High ROX Premixed) |
|||
NQ104-500rxns | Vazyme | 500 rxns | 181.21 EUR |
Apoptotic, Necrotic & Healthy Cells Quantification Kit (50 assays) |
|||
30018-1 | Biotium | KT | 242 EUR |
ExoQualiTM Total Exosome Capture & Quantification Kit (Plasma) |
|||
CEIK-108L-96wells | Creative Bioarray | 96 wells | Ask for price |
HDL and LDL/VLDL Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K2122-100 | ApexBio | 100 assays | 1024 EUR |
HDL and LDL/VLDL Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K613-100 | Biovision | each | 783.6 EUR |
Sunlong Medical™ Human ACBD6 ELISA Kit For Protein Quantification |
|||
EL0303Hu-48T | Sunlong | 48T | 398 EUR |
Sunlong Medical™ Human ACBD6 ELISA Kit For Protein Quantification |
|||
EL0303Hu-96T | Sunlong | 96T | Ask for price |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Cell Cycle Regulation - TS |
|||
P-5005 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
EpiQuik Methylated DNA Immunoprecipitation Kit |
|||
P-2019 | EpiGentek |
|
|
Detergent Compatible Bradford Protein Quantification Kit |
|||
E211-01 | Vazyme | 500 rxn | 213.6 EUR |
EpiQuik 8-OhG RNA Damage Quantification Direct Kit (Colorimetric) |
|||
P-6008 | EpiGentek |
|
|
MycoLightâ„¢ Fluorimetric CTC Live Bacteria Quantification Kit |
|||
22405-100Tests | AAT Bioquest | 100 Tests | 334 EUR |
Free Fatty Acid Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K2121-100 | ApexBio | 100 assays | 902.4 EUR |
Free Fatty Acid Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K612-100 | Biovision | each | 732 EUR |
ExoTEST™ for Overall Exosome capture and quantification from Cell media |
|||
HBM-RTK-POC/TC | HansaBioMed | KIT | 506.52 EUR |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Cell Death/Apoptosis - XIAP |
|||
P-5004 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Cell Proliferation - Wnt 4 |
|||
P-5006 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Signal Transduction - ViDR |
|||
P-5008 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Transcription Factor - YY-1 |
|||
P-5009 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
Triglyceride Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K2127-100 | ApexBio | 100 assays | 924.8 EUR |
Triglyceride Quantification Colorimetric/Fluorometric Kit |
|||
K622-100 | Biovision | each | 744 EUR |
RNase Activity Detection/Quantification Assay Kit (Fluorometric) |
|||
K934-100 | Biovision | each | 574.8 EUR |
ExoTEST™ for Overall Exosome capture and quantification from human plasma |
|||
HBM-RTK-POF/TP | HansaBioMed | KIT | 506.52 EUR |
ExoTEST™ for Overall Exosome capture and quantification from human urine |
|||
HBM-RTK-POF/TU | HansaBioMed | KIT | 506.52 EUR |
ExoTEST™ for Overall Exosome capture and quantification from human serum |
|||
HBM-RTK-POS/TS | HansaBioMed | KIT | 506.52 EUR |
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K9 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4010 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K9 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4011 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K5 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4022 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K5 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4023 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K8 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4024 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K8 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4025 | EpiGentek |
|
|
Fully CpG Methylated Human Genomic DNA |
|||
X10000 | EpiGentek | 10 µg/100 µl | Ask for price |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Epigenetic Regulators - TFIIB |
|||
P-5002 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
QuantiSir Specific Gene Knockdown Quantification Kit For Tumor Suppressor/Oncogene - WT-1 |
|||
P-5007 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
ExoQualiTM Total Exosome Capture & Quantification Kit (Cell Supernatant) |
|||
CEIK-109L-96wells | Creative Bioarray | 96 wells | Ask for price |
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3022 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3023 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3032 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3033 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H4R3 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3090 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Circulating Total Histone H3 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3091 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3R8 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3096 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K14 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4012 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K14 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4013 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K18 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4014 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K18 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4015 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K23 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4016 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K23 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4017 | EpiGentek | 96 Assays | 945.66 EUR |
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K36 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4018 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K36 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4019 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K56 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4020 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K56 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4021 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K16 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4026 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K16 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4027 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K12 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4028 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H4K12 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-4029 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Acetyl Histone H3K27 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-4059 | EpiGentek |
|
|
EZScreen? Triglyceride Quantification Colorimetric Assay Kit (384-well) |
|||
K952-400 | Biovision | each | 751.2 EUR |
ExoELISA-Step for detection and quantification of exosomes from cell culture |
|||
Exo2506 | ImmunoStep | 96 | 654.5 EUR |
EpiQuik Global Mono-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3024 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Mono-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3025 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3026 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3027 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3028 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K4 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3029 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Mono-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3030 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Mono-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3031 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3034 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3035 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3036 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K9 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3037 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3040 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3041 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3042 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3043 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3044 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K27 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3045 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3048 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3049 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3050 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Tri-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3051 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3052 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Pan-Methyl Histone H3K36 Quantification Kit (Fluorometric) |
|||
P-3053 | EpiGentek |
|
|
EpiQuik Global Di-Methyl Histone H3K79 Quantification Kit (Colorimetric) |
|||
P-3056 | EpiGentek |
|
|
Patrząc na wyniki NCI, oddziaływania te pochodzą nie tylko z oddziaływań CH/π i CH/n grupy metylowej w pozycji 4, ale także z ligandu etylenodiaminy (en), którego orientację w kompleksie Pt stwierdzono w ten sposób że wytwarza dużą liczbę słabych interakcji z DNA, zwłaszcza ze szkieletem cukrowym i fosforanowym